食物檢測的指標主要有：食品通用成分分析、微量元素分析、農藥殘留分析、獸藥殘留分析、霉菌毒素分析、食品添加劑分析及其它有害物質分析。每個指標的檢驗將根據被檢查項目的特征相應地進行相應的檢驗方法。

食品安全綜合分析儀可以檢測食品的安全性，食品是否含有農藥殘留，農藥殘留的具體含量，保障市場環境的安全制度。在挑選食品安全綜合分析儀時，需盡可能地選取可實現自校的儀器，從而確保精度的可調可控，同時操作人員需設置合理的自校時間間隔，按期校對儀器，在儀器操作前也需進行校對。